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要在 Tomcat 中配置 JNDI 数据源，可以按照以下步骤进行操作：

1、在 Tomcat 的 conf 目录下的 server.xml 文件中添加如下配置：

<Resource name="jdbc/myDataSource" auth="Container" type="javax.sql.DataSource"
               maxTotal="100" maxIdle="30" maxWaitMillis="10000"
               username="your_username" password="your_password"
               driverClassName="com.mysql.cj.jdbc.Driver"
               url="jdbc:mysql://localhost:3306/your_database"
/>

其中 name 属性是数据源的 JNDI 名称，可以根据自己的需求修改；auth 属性为 Container 表明使用 Tomcat 的安全机制；maxTotal、maxIdle 和 maxWaitMillis 为连接池的参数；username 和 password 为数据库的用户名和密码；driverClassName 为数据库驱动的类名；url 为数据库的连接地址。

2、在 web.xml 文件中添加 JNDI 资源引用的配置：

<resource-ref>
    <res-ref-name>jdbc/myDataSource</res-ref-name>
    <res-type>javax.sql.DataSource</res-type>
    <res-auth>Container</res-auth>
</resource-ref>

3、在应用程序的代码中使用 JNDI 数据源：

Context ctx = new InitialContext();
DataSource ds = (DataSource) ctx.lookup("java:comp/env/jdbc/myDataSource");
Connection conn = ds.getConnection();

通过以上步骤，就可以在 Tomcat 中配置并使用 JNDI 数据源了。需要注意的是，不同版本的 Tomcat 可能有些许差异，建议查阅对应版本的官方文档以获取更详细的配置信息。

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